三百年前、諸葛孔明は「天機府」という調停組織を設立し、 魏、蜀、呉の三分天下を維持していた。 しかし、「天機府」の大将軍である孔明の子孫–諸葛永継が野心家たちによって殺され、 天下は再び戦乱の世となった。 死んだはずの諸葛永継であったが、謎の先祖の魂に取り憑かれたことにより、 不思議な瞳と異能力を手に入れ復活を果たした。 そして、彼と同じように、不思議な瞳と異能力を持つ武将が次々と現れ、 新たな三国時代が幕を開ける。