夢の宇宙飛行士を目指し、塾に通っている無口すぎる元ヤンキー・碇石（いかりいし）くんは同じ塾の留年生・対馬比呂奈（つしま・ひろな）の抱える問題に直面する。頑張ることから逃げるばかりの彼女は、進級できなかったことで自暴自棄になっていた。「自分を変えたい」と願う比呂奈と、碇石くんは向き合う決意をする――！　高校一年生のラブ＆ドリーム！　『ヤンキー塾へ行く』の“塾編”スタート！　偏差値70の元ヤンキーによる偏差値39の留年少女、再生計画!!

奪われた絆を取り戻す、少年たちの戦い―――その序章。 高校生の坂本ケンジは、東京・秋葉原で殺戮テロを起こした現行犯へ、接触を試みようとしていた。全ては姿を消した幼馴染の親友・ナオの行方を追うために……。 彼らに、何があったのか――。 物語は事件の１年前、北関東の片隅より語られる――！